Perbezaan Antara Exome dan Transkrip | Exome vs. Transcriptome

Anonim

Perbezaan Utama - Exome vs Transkrip

Gen mengandungi kod pengekodan dan bukan pengekodan di dalamnya. Urutan pengekodan dikenali sebagai exon, dan urutan tidak berkod dikenali sebagai intron. Urutan nucleotide dari exon gen mewakili kod genetik gen untuk mensintesis protein spesifik. Oleh itu, exon kekal dalam molekul mRNA. Keseluruhan rantau exon genom dikenali sebagai exome, dan ia merupakan bahagian penting dalam genom. Kod genetik gen diubah menjadi kod genetik molekul mRNA, yang diperlukan untuk menghasilkan protein. Seluruh molekul mRNA yang ditranskripsikan dalam sel atau populasi sel pada satu masa dikenali sebagai transkrip. Perbezaan utama di antara exome dan transkrip ialah exome mewakili urutan wilayah ekson genom

manakala transkrip mewakili total mRNA sel atau tisu pada masa yang diberikan. KANDUNGAN

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama 2. Apakah Exome

3. Apakah Transkrip

4. Perbandingan Side by Side - Exome vs Transkrip

5. Ringkasan

Apakah Exome?

Gen terdiri daripada exons, introns dan urutan peraturan. Tanda-tanda adalah kawasan gen yang ditranskripsikan ke dalam urutan mRNA semasa transkripsi. Intron dan kawasan bukan pengekodan lain dikeluarkan semasa transkripsi. Urutan nucleotide exons menentukan kod genetik gen yang mensintesiskan protein spesifik kod itu. Hanya exon kekal dalam mRNA protein. Koleksi exo dalam genom dikenali sebagai exome dari organisma. Ia mewakili sebahagian daripada genom yang dinyatakan dalam gen. Pada manusia, exome menyumbang 1% daripada genom. Ia adalah bahagian protein pengekodan genom manusia.

Rajah 01: Exome

Apakah transkrip?

Transkrip adalah pengumpulan semua transkrip pengkodan dan pengekodan protein (RNA) dalam tisu tertentu. Transkrip mewakili pengumpulan jumlah molekul mRNA yang dinyatakan oleh gen dalam sel atau tisu. Transkrip sel boleh diubah dengan transkrip jenis sel yang lain. Transkrip ini juga dinamik - ia berubah dengan masa sebagai tindak balas kepada rangsangan dalaman dan luaran. Walaupun dalam tisu yang sama atau dalam jenis sel yang sama, transkrip boleh berubah selepas beberapa minit.

Transkrip adalah berbeza daripada organisme. Transkrip hanya termasuk urutan exome yang dinyatakan.Walaupun exome sel tetap sama, transkrip berbeza di antara sel-sel kerana ungkapan gen tidak sama untuk semua sel atau tisu. Hanya gen penting yang dinyatakan dalam sel dan tisu yang berlainan. Ekspresi gen adalah tisu atau proses khusus jenis sel. Ia dikawal oleh pelbagai faktor termasuk faktor persekitaran. Oleh itu, transkrip boleh berbeza dengan keadaan persekitaran luaran.

Transkrip digunakan sebagai pendahulu untuk kajian proteomik. Semua protein berasal dari urutan mRNA. Pengubahsuaian translasi boleh menyebabkan perubahan dalam protein. Walau bagaimanapun, transkrip menyediakan maklumat asas yang penting untuk kajian-kajian proteomik.

Gambar 02: Transkrip sel embrionik embrio

Apakah perbezaan antara Exome dan Transkrip?

- Diff Artikel Tengah sebelum Jadual ->

Exome vs Transkrip

Exome adalah koleksi wilayah pengkodan protein gen.

Transkrip adalah pengumpulan semua RNA yang disalin termasuk mRNA.

Contoh Exome dikaji menggunakan sampel DNA.
Transkrip boleh dikaji menggunakan sampel RNA.
Kaedah Kajian Penjujukan exome keseluruhan adalah kaedah belajar exome. Jujukan
RNA adalah cara mengkaji transkrip.
Ringkasan - Exome vs Transkrip Exons adalah urutan pengekodan gen dan menentukan urutan mRNA protein. Pengumpulan urutan pengekodan ini (exons) dikenali sebagai exome dari organisma. Gen ditranskrip ke dalam molekul mRNA sebelum membuat protein. Molekul molekul keseluruhan sel atau tisu pada satu masa tertentu dikenali sebagai transkrip. Transkrip mewakili gen yang secara aktif diungkapkan kepada mRNA pada bila-bila masa. Transkrip adalah sel dan tisu khusus dan memberi kesan kepada keadaan persekitaran. Inilah perbezaan di antara exome dan transkrip.

Rujukan:

1. Sarah et al, "Tangkapan Berjangkit dan Sequencing Paralel Massal Dua Puluh Manusia. "Alam. U. S. Perpustakaan Perubatan Negara, 10 Sept. 2009. Web. 01 Apr. 2017

2. Mutz et al. "Analisis transkrip menggunakan penjujukan generasi akan datang. "Elsevier: Pencari Artikel. N. p., Sept. 2012. Web. 01 Apr. 2017

Image Courtesy:

1. "Transkrip sel-sel pluripotent" oleh Grskovic, M. dan Ramalho-Santos, M., Transkrip teks pluripotent (10 Oktober 2008), StemBook, ed. Komuniti Penyelidikan Stem Cell, StemBook, doi / 10. 3824 / stembook. 1. 24. 1, // www. stembook. org. - [1] DirectStemBook Rajah 2 Transkrip sel-sel pluripotent. Grskovic, M. dan Ramalho-Santos, M., Transkrip teks pluripotent (10 Oktober 2008), StemBook, ed. Komuniti Penyelidikan Stem Cell, StemBook, doi / 10. 3824 / stembook. 1. 24. 1, (CC BY 3. 0) melalui Wikimedia Commons