Perbezaan Antara Benzonase dan DNase | Benzonase vs DNase

Key Perbezaan - Benzonase vs DNase

Degradasi asid nukleik adalah penting untuk banyak teknik biologi molekul. Ia digunakan secara meluas dalam teknologi DNA rekombinan untuk menghilangkan serpihan DNA dan RNA yang tidak diingini. Asid nukleik yang merendahkan enzim dirujuk sebagai Nukleus, dan mereka boleh berbeza mengikut fungsi yang diperlukan. Nukleases yang merendahkan DNA dikenali sebagai DNases sedangkan yang merendahkan RNA dikenali RNases. Enzim ini kebanyakannya digunakan dalam eksperimen in vitro di mana ujian molekul dalam vitro dijalankan untuk mengasingkan DNA tulen, RNA atau protein. Benzonases adalah jenis nukleus yang merendahkan DNA dan RNA manakala DNases merosot DNA sahaja. Ini adalah perbezaan utama antara Benzonase dan DNase.

KANDUNGAN

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama

2. Apakah Benzonase

3. Apakah DNase

4. Kesamaan Antara Benzonase dan DNase

5. Perbandingan Side by Side - Benzonase vs DNase dalam Borang Tabular

6. Ringkasan

Apakah Benzonase?

Benzonase adalah endonuclease kejuruteraan genetik dari Serratia marcescens. Enzim ini dihasilkan di E. coli tuan rumah dalam skala perindustrian. Benzonase mampu mempertahankan DNA double-stranded, DNA linier, DNA pekeliling dan RNA tunggal terkandas. Oleh itu, Benzonase adalah penting secara komersil. Enzim Benzonase adalah dimer protein yang mempunyai 245 asid amino yang sama, ~ 30 kDa subunit dengan dua ikatan disulfida penting. Benzonase memecahkan asid nukleik pada akhir 5 'dan menghasilkan serpihan dengan 5''''''''''''lain. Benzonase boleh memecahkan asid nukleat pada sebarang urutan tetapi lebih suka kawasan kaya GC.

Benzonase disimpan di -20 ⁰ C. PH optimum untuk aktiviti enzim didapati 8. 0 - 9. 2. Penggunaan Benzonase termasuk penyediaan sampel untuk elektroforesis gel 2D protein di mana Benzonase menghilangkan asid nukleat dan menghilangkan pencemar asid nukleik daripada persediaan protein rekombinan. Ia juga digunakan untuk mengurangkan kelikatan ekstrak protein dan mencegah pengumpanan sel dalam campuran sel.

Apa itu DNase?

DNase adalah sejenis enzim hidrolisis, yang hanya dapat mengekang DNA dua stranded. Terdapat dua jenis utama DNases: DNase I dan DNase II. DNase I mengambil bahagian dalam membasmi DNA double stranded untuk menghasilkan polynucleotides dengan 5 'hujung percuma. DNase II terlibat dalam mengekang DNA double-stranded untuk menghasilkan helai polynucleotide dengan 3 'hujung percuma atau overhangs.

DNase I

DNase I berfungsi pada pH optimum antara 7. 0 - 8. 0. Aktiviti enzim bergantung kepada banyak koefaktor ionik yang termasuk, Ca ²⁺ , Mg ^{2 +} atau Mn ²⁺ . Aktiviti Mg ²⁺ dan Mn ²⁺ memutuskan fungsi DNase I. Dengan kehadiran Mg ²⁺ , DNase I memecahkan setiap helai dsDNA secara bebas. Ini berlaku secara rawak. Sebaliknya, dengan kehadiran Mn ^2+, enzim itu memecah kedua-dua helai DNA di sekitar tapak yang sama. Pembahagian ini akan menghasilkan dua jenis serpihan DNA; satu jenis dengan hujung tumpul dan satu lagi jenis dengan satu atau dua overhang nukleotida.

Rajah 02: DNase

DNase II

DNase II berfungsi pada pH optimum 4. 5-5. 0 dan ion logam divalen diperlukan untuk aktivitinya, sama seperti DNase I. Mekanisme DNase II diketahui terdiri daripada tiga langkah utama.

1. Pelbagai strand tunggal tunggal diinduksi dalam tulang belakang DNA.
2. Nukleotida larut asam dan oligonukleotida dihasilkan.
3. Anjakan hyperchromic tidak linear berlaku pada fasa terakhir.

Perencat utama enzim DNase termasuk chelators logam, logam peralihan dan bahan kimia seperti natrium dodecyl sulfate dan β - mercaptoethanol.

Aplikasi utama DNase termasuk penyediaan ekstrak RNA DNA dan ekstrak protein tanpa DNA, dan penyingkiran DNA template semasa eksperimen transkripsi in vitro.

Apakah Kesamaan Antara Benzonase dan DNase?

• Kedua-duanya adalah enzim hidrolisis.
• Kedua-duanya adalah nukleus.
• Kedua-duanya menyertai dengan mengekalkan ikatan fosfodiester asid nukleik.
• Kedua-duanya memerlukan pH optimum dan suhu penyimpanan untuk mengekalkan aktiviti enzim.
• Perencat enzim termasuk agen chelating, logam peralihan, dan bahan kimia pencuci.
• Aplikasi terutamanya tertumpu pada mendapatkan ekstrak ketulenan tinggi DNA, RNA, dan protein.
• Kedua-dua enzim boleh dihasilkan melalui kejuruteraan genetik.

Apakah Perbezaan Antara Benzonase dan DNase?

- diff Artikel Tengah sebelum Jadual ->

Benzonase vs DNase
Benzonase adalah enzim yang mampu menanggalkan DNA double-stranded, DNA linier, DNA bulat dan RNA.	DNase adalah enzim yang mampu menanggalkan DNA double-stranded.
Substrat untuk Enzim
Kedua-dua DNA dan RNA adalah substrat untuk benzonase.	DNA adalah substrat untuk DNase.
Struktur
Rangkaian optimum pH Benzonase adalah 7. 0 -8. 0	Rangkaian pH optimum DNase I adalah 7. 0 - 8. 0 dan DNase II adalah 4. 5 - 5. 0.

Ringkasan - Benzonase vs DNase

Enzim nuklease digunakan secara meluas dalam pelbagai prosedur percubaan berhubung dengan biologi molekul dan kejuruteraan genetik. Benzonase dan DNase adalah dua jenis nukleus. Benzonase terlibat dalam merendahkan kedua-dua DNA dan RNA manakala DNase terlibat dalam mengekang DNA double-stranded. Ini adalah perbezaan asas antara benzonase dan DNase. Pada masa ini, kedua jenis nikmat ini dihasilkan melalui teknologi DNA rekombinan yang menghasilkan enzim berkualiti tinggi yang dioptimumkan untuk pengeluaran maksimum.

Muat turun Versi PDF dari Benzonase vs DNase

Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian seperti peringatan kutipan. Sila muat turun versi PDF di sini Perbezaan Antara Benzonase dan DNase

Rujukan:

1. "Deoxyribonuclease saya dari pancreas lembu D5025. "Sigma-Aldrich, terdapat di sini. Diakses 19 Sept. 2017.

2. "Deoxyribonuclease II. "Deoxyribonuclease II - Worthington Enzyme Manual, Boleh didapati di sini. Diakses pada 19 Sept. 2017.

Image Courtesy:

1. "Laman DNA hipersensitif" oleh Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, et al. - Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, et al. (2012) Korelasi Antara DNase I Pengedaran Tapak Hypersensitive dan Ekspresi Gene di Sel S HeLa S3. PLOS ONE 7 (8): e42414. doi: 10. 1371 / jurnal. pon. 0042414 (CC BY-SA 2. 5) melalui Wikimedia Commons