Perbezaan Antara Perbaikan Base Excision dan Nucleotide Excision Repair | BER vs NER
Perbezaan Utama - Pembaikan Excise Base vs Pembaikan Eksterior Nukleotida
DNA sering tertakluk untuk merosakkan kerana pelbagai faktor dalaman dan luaran. Walau bagaimanapun sistem pembaikan sel-sel segera dan sentiasa membetulkan kerosakan sebelum menjadi mutasi atau sebelum mereka dipindahkan ke generasi berikutnya. Terdapat tiga jenis sistem pembaikan excision di dalam sel: pembaikan excision nukleotida (NER), pembaikan tulang belakang asas (BER), dan pembetulan tidak sepadan DNA (MMR) untuk membaiki ganti rugi DNA terkandas. Perbezaan utama antara pembaikan basali asas dan pembaikan ejen nukleotida adalah pembaikan basali asas adalah sistem pembaikan mudah yang bekerja di dalam sel untuk membaiki kerosakan nukleotida tunggal yang disebabkan endogen manakala pembaikan excisional nukleotida adalah pembaikan kompleks sistem yang berfungsi di dalam sel untuk membaiki kawasan yang agak besar, rosak yang disebabkan exogenously.
KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah Base Repair Repair
3. Apakah Pembaikan Eksterior Nukleotida
4. Side by Comparison Side - Pembaikan Excision Base vs Repair Excision Nucleotide
5. Ringkasan
Apakah Base Repair Excision?
Pembaikan eksisi asas adalah versi paling mudah bagi sistem pembaikan DNA yang mempunyai sel-sel. Ia digunakan untuk membaiki kerosakan kecil dalam DNA. Pangkalan DNA diubahsuai kerana deaminasi atau alkilasi. Apabila terdapat kerosakan asas, glycosylase DNA mengenal pasti dan mengaktifkan sistem pembaikan excision asas dan mendapatkannya dengan bantuan enzim AP endonuclease, polimerase DNA, dan ligase DNA. Berikutan langkah-langkah yang terlibat dalam sistem BER.
- Pengiktirafan dan penyingkiran asas yang tidak betul atau rosak oleh glikosilase DNA untuk mewujudkan tapak abas (tapak kehilangan asas -apiurinik atau apyrimidinic).
- Gunting tapak Abasic oleh endonuclease apurinic / apyrimidinic
- Pembuangan selebihnya daripada fragmen gula oleh lyase atau phosphodiesterase
- Gap yang dipenuhi oleh polimerase DNA
- Pengedap nick oleh ligase DNA
Rajah 01: Jalur pembaikan asas pengasingan
Apakah Pembaikan Eksterior Nukleotida?
Pembaikan Eksterior Nukleotida (NER) adalah sistem pembaikan pengasingan DNA penting dalam sel. Ia dapat memperbaiki dan menggantikan kawasan yang rosak sehingga 30 asas panjang dan ia diarahkan oleh helai template yang tidak rosak.Kerosakan DNA biasa berlaku akibat radiasi ultraviolet dan NER melindungi DNA dengan membaiki kerosakan tersebut segera sebelum menjadi mutasi dan mengalir ke generasi masa depan atau menyebabkan penyakit. NER secara khusus memberikan perlindungan terhadap mutasi yang disebabkan secara tidak langsung oleh faktor-faktor eksogen seperti karsinogenik alam sekitar dan kimia. NER dilihat pada hampir semua organisma, dan ia mengakui kerosakan yang menyebabkan gangguan besar dalam helix DNA.
Proses NER melibatkan tindakan banyak protein seperti XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB, dan lain-lain dan meneruskan melalui beberapa mekanisme pemotongan dan paste seperti. Protein adalah penting untuk menyelesaikan proses pembaikan dan kecacatan pada salah satu protein NER adalah penting dan boleh menyebabkan sindrom reses jarang: xeroderma pigmentosum (XP), Cockayne syndrome (CS) dan bentuk fotosensitif gangguan rambut rapuh trichothiodystrophy (TTD).
Rajah 02: Pembaikan Eksterior Nukleotida
Apakah perbezaan antara Repair Excision Base dan Repair Excision Nucleotide?
- Diff Artikel Tengah sebelum Jadual ->
Pembaikan Excision Base vs Pembaikan Eksterior Nukleotida |
|
| Pembaikan pengasingan asas (BER) adalah sistem pembaikan DNA yang berlaku di dalam sel. | Pembaikan elektrolit nukleotida (NER) adalah satu lagi jenis sistem pembaikan DNA yang terdapat di dalam sel. |
| Mengakui Adduct DNA | |
| BER membaiki kerosakan kepada tambahan DNA kecil. | NER membaiki penambahan DNA besar. |
| Kerugian DNA | |
| BER mengakui kerosakan yang tidak menyebabkan gangguan besar kepada helix DNA. | NER mengiktiraf kerosakan yang menyebabkan gangguan besar kepada helix DNA. |
| Punca Kerosakan DNA | |
| BER membaiki kerosakan yang disebabkan oleh mutagen endogen. | NER membaiki kerosakan yang disebabkan oleh mutagen eksogen. |
| Kerumitan | |
| BER adalah sistem pembaikan kompleks yang paling kurang | Ia lebih kompleks daripada BER. |
| Keperluan Protein | |
| BER tidak memerlukan protein lain. | NER memerlukan beberapa produk gen, terutamanya protein, untuk mendiskriminasikan kawasan rosak dan tidak rosak. |
| Kesesuaian | |
| BER sesuai untuk membetulkan ganti rugi asas tunggal. | NER sesuai untuk menggantikan kawasan yang rosak. |
Ringkasan - Pembaikan Eksterior Base vs Pembaikan Eksterior Nukleotida
NER dan BER adalah dua jenis proses pembaikan pengasingan DNA yang terdapat di dalam sel. BER mampu membaiki kerosakan kecil yang disebabkan endogen manakala NER mampu membaiki kawasan kerosakan sehingga 30 pasangan panjang yang disebabkan kebanyakannya oleh eksogen. BER berbeza dengan NER dalam jenis substrat yang diiktiraf dan dalam peristiwa belahan awal. BER juga boleh mengiktiraf kerosakan yang tidak disebabkan oleh gangguan besar dalam helix DNA manakala NER mengiktiraf penyimpangan besar helix DNA. Ini adalah perbezaan di antara pembaikan basali asas dan pengasingan nukleotida.
Image Courtesy:
1. "Pembaikan asas pembaikan kod en" Oleh LadyofHats - (Domain Awam) melalui Wikimedia Commons
2. "Perwakilan skema model untuk laluan pembaikan nukleotida dikawal oleh protein Uvr" Oleh Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui, dan Seiki Kuramitsu - (CC BY 1.0) melalui Wikimedia Commons
Rujukan:
1. Kim, Yun-Jeong, dan David M. Wilson. "Tinjauan Biokimia Pembaikan Excision Base. "Farmakologi molekul semasa. U. S. Perpustakaan Perubatan Negara, Jan. 2012. Web. 14 Mac 2017.
2. Boer, Jan De, dan Jan H. J. Hoeijmakers. "Pembaikan excision nukleotida dan sindrom manusia. "Karsinogenesis. Oxford University Press, Mac 01 2000. Web. 28 Mac 2017
3. Hoogstraten et al. "Pengesanan kerosakan DNA serba boleh oleh XPC protein pembaikan genom nukleotida global. "Jurnal Sains Sel. Syarikat Biologists Ltd, 01 Sept. 2008. Web. 28 Mac 2017
