Perbezaan Antara Genotyping dan Sequencing | Genotyping vs Sequencing

Perbezaan Utama - Genotyping vs Sequencing

Genotyping dan penjujukan adalah dua teknik yang dilakukan untuk mendapatkan maklumat mengenai asid nukleik, terutamanya DNA organisma. Perbezaan utama antara genotyping dan sequencing ialah genotyping adalah proses menentukan varian genetik yang individu itu menggunakan penanda semasa penjujukan adalah penentuan susunan urutan nukleotida yang betul dalam fragmen DNA yang diberikan.

KANDUNGAN

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama

2. Apakah Genotyping

3. Apakah Sequencing

4. Perbandingan Side by Side - Genotyping vs Sequencing

5. Ringkasan

Apakah Genotyping?

Genotyping adalah penentuan ciptaan genetik individu menggunakan urutan DNA dan penanda dan perbandingan dan pengenalpastian warisannya. Genotyping adalah penting dalam biologi evolusi, biologi populasi, taksonomi, ekologi, dan genetik organisma. Ia boleh dilakukan dengan teknik yang berbeza termasuk penjujukan DNA, tindak balas rantai polimerase, polimorfisme panjang pecahan pecahan (RFLP), pengesanan polimorfik rawak yang diperkuat, menguatkan polimorfisme panjang serpihan (AFLP), microarray DNA, dan sebagainya.

Genotyping melibatkan penjujukan serpihan kecil tertentu urutan DNA dan mencari keterkaitan komposisi genetik dengan individu lain yang menggunakan penanda genetik. Ia menentukan polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) di kalangan individu atau alel tertentu. Genotyping boleh digunakan untuk pelbagai organisma termasuk manusia. Ia juga boleh digunakan untuk mikroorganisma seperti virus, kulat dan lain-lain dan boleh digunakan untuk menentukan varian genetik mereka dengan profil rujukan. Dalam epidemiologi molekul dan mikrobiologi forensik, mengawal patogen, terutama mikroorganisma, dilakukan dengan maklumat yang diperolehi daripada genotip. Genotyping sangat penting dalam analisis silsilah. Manusia genotip untuk mengesahkan keibuan dan kehamilan. Genotype akan mendedahkan alel dominan dan resesif gen yang menentukan ciri-ciri tertentu.

Figure_1: Genotyping RFLP

Apakah urutan?

Sequencing adalah proses menentukan urutan nukleotida yang betul dalam fragmen DNA atau RNA yang diberikan. Hampir semua maklumat yang diperlukan untuk pertumbuhan dan perkembangan organisma dikodkan dalam genomnya. Ketersediaan teknik untuk menghasilkan dan memisahkan seratus nukleotida serpihan asid nukleik yang panjang membawa kepada perkembangan prosedur menentukan urutan nukleotida yang tepat dari fragmen DNA atau RNA yang diberikan.Kaedah penjujukan pelbagai jenis boleh didapati pada hari ini. Kaedah penjujukan ini, bersama-sama dengan teknologi untuk pembinaan perpustakaan genom yang mewakili seluruh genom organisma, memudahkan penjujukan seluruh genom organisma itu, membuat analisa mendalam struktur gen, fungsi gen, lokasi gen, ekspresi gen, pemetaan gen, kawasan pengawalseliaan gen dan sebagainya.

Jumlah genom banyak virus, beberapa bakteria, archaebacteria, yis dan beberapa organisma lain telah disusun dan dipetakan. Projek genom manusia telah memungkinkan untuk menyusun dan memetakan keseluruhan genom manusia dan menerbitkan draf pertama pada tahun 2003. Ini adalah pencapaian utama dalam perkembangan biologi. Urutan genom manusia kini digunakan dalam sektor perubatan untuk mengenal pasti punca-punca genetik untuk penyakit jarang berlaku, risiko penyakit skrin pada bayi baru lahir, mengenalpasti butiran genetik kanser yang berbeza, membangun terapeutik baru, dan membangunkan alat diagnostik baru, dan lain-lain., genom beras dan genom Arabidopsis telah disusun. Pengetahuan mengenai urutan ini pasti akan merevolusikan pemahaman kita tentang bagaimana fungsi sel dan organisma.

Figure_2: Autoradiograph of sequencing sanger

Apakah perbezaan antara Genotyping dan Sequencing?

- Diff Artikel Tengah sebelum Jadual ->

Genotyping vs Sequencing
Genotyping adalah proses menentukan komposisi genetik individu dan memeriksa kumpulan atau taksonomi organisma itu.	Sequencing adalah proses menentukan susunan nukleotida yang tepat dari fragmen DNA atau RNA yang diberikan.
Teknik
RFLP, penjujukan gen, PCR, microarray DNA, AFLP dan sebagainya.	Sanger sequencing, Gilbert sequencing, Pyrosequencing, Next Generation Sequencing, prihatin sama ada perbezaan genotip memberikan perbezaan fenotip sebenar.
Ini lebih mempedulikan susunan nukleotida dan perbezaannya dan perubahan dengan organisma lain.
Ringkasan - Genotyping vs Sequencing	Genotyping dan penjujukan adalah berguna untuk mengkaji maklumat genetik organisma. Genotyping adalah proses menentukan variasi genotip di kalangan individu dan mencari kategori mereka. Urutan adalah proses menentukan urutan nukleotida yang betul dalam serpihan yang berminat atau rantau DNA. Kedua-dua teknik memberikan maklumat penting mengenai gen dan genom.

Rujukan:

1. "Kaedah genotip. "Kaedah dalam biologi molekul (Clifton, N. J.). U. S. Perpustakaan Perubatan Negara, n. d. Web. 20 Feb. 2017.

2. Akey, J. M., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin, dan M. D. Shriver. "Analisis Curve Lelong SNP (McSNP ): Pendekatan Gel-Percuma dan Tidak Murah untuk SNP Genotyping. "BioTechniques 30. 2 (2001): 358-67. Web.

Image Courtesy:

1. "Genotip RFLP" Oleh (tidak diketahui) - Institut Kesihatan Nasional (Domain Awam) melalui Wikimedia Commons

2."Fluorescent Radioaktif" Oleh Abizar di Wikipedia Bahasa Inggeris (CC BY-SA 3. 0) melalui Wikimedia Commons