Perbezaan Antara Perkataan Nick dan Tambahan Primer | Nick Translation vs Extension Primer

Anonim

Perbezaan Utama - Nick Translation vs Extension Extension

Terjemahan Nick dan sambungan primer adalah dua teknik penting yang dilakukan dalam biologi molekular. Perbezaan utama antara penterjemahan nick dan sambungan primer adalah bahawa proses terjemahan nick menghasilkan probe berlabel untuk teknik hibridisasi lain manakala kaedah lanjutan primer mengenal pasti urutan RNA tertentu dari campuran dan mendedahkan maklumat tentang ekspresi mRNA. Kedua-dua teknik ini amat penting dan dilakukan secara rutin dalam makmal penyelidikan molekul.

KANDUNGAN

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama

2. Apakah penterjemahan Nick

3. Apakah Peluasan Primer

4. Perbandingan Side by Side - Nick Translation vs Primer Extension

5. Ringkasan

Apakah Terjemahan Nick?

Terjemahan Nick adalah teknik penting yang digunakan untuk mempersiapkan probe berlabel untuk pelbagai teknik biologi molekular seperti pembongkaran, in situ hibridisasi, pendarfluor in situ hibridisasi dan lain-lain. in vitro kaedah penanda DNA. Probe DNA digunakan untuk mengenal pasti urutan DNA atau RNA tertentu. Dengan bantuan siasatan berlabel, serpihan spesifik dapat ditandai atau divisualisasikan dari campuran kompleks asid nukleik. Oleh itu, probe berlabel disediakan menggunakan pelbagai teknik untuk digunakan untuk teknik yang berbeza. Terjemahan Nick adalah salah satu kaedah yang menghasilkan probe berlabel dengan bantuan enzim DNase 1 dan DNA polimerase 1.

Proses terjemahan nick bermula dengan aktiviti enzim DNase 1. DNase 1 memperkenalkan nicks pada tulang belakang fosfat DNA terkandas ganda dengan menahan ikatan fosfodiester antara nukleotida. Sebaik sahaja nick dicipta percuma 3 'OH kumpulan nukleotida akan dihasilkan dan polimerase 1 enzim DNA akan bertindak di atasnya. 5 'hingga 3' aktiviti exonuclease DNA polimerase 1 membuang nukleotida dari nikel ke arah arah '3 untaian DNA. Pada masa yang sama, aktiviti polimerase enzim polimerase 1 berfungsi dan menambah nukleotida untuk menggantikan nukleotida yang dikeluarkan. Sekiranya nukleotida dilabel, penggantian akan berlaku oleh nukleotida berlabel dan ia akan menandakan DNA untuk pengenalpastian. DNA berlabel yang disintesis ini boleh digunakan sebagai probe dalam pelbagai tindak balas hibridisasi dalam Biologi Molekul.

Rajah 01: Proses penterjemahan Nick

Apakah Peluasan Primer?

Lanjutan primer adalah teknik yang digunakan untuk mencari turutan RNA tertentu dari campuran RNA dan mencari 5 'akhir transkrip mRNA. Ia juga digunakan untuk mengkaji struktur RNA dan ungkapan. Kaedah pelanjutan primer dilakukan dengan primer berlabel atau dengan nukleotida berlabel. Sekiranya berlabel primers digunakan, ia tidak termasuk keperluan melabelkan nukleotida yang digunakan untuk sintesis cDNA. Terdapat beberapa langkah dalam teknik ini. Ia bermula dengan pengekstrakan RNA dari sampel. Kemudian primer oligonukleotide yang dilabel ditambahkan kepada campuran bersama-sama dengan bahan-bahan yang diperlukan untuk mensintesiskan cDNA urutan RNA tertentu. Primer anneals dengan urutan pelengkap dari campuran. Menggunakan turunan anne primer seperti templat, transkripase enzim terbalik mensintesiskan DNA pelengkap (cDNA) urutan RNA. Penyepitan primer dan transkripsi terbalik hanya berlaku apabila urutan RNA khusus ada di dalam sampel. Akhir sekali, apabila penentuan elektroforesis gel dilakukan, saiz urutan RNA dapat ditentukan. Ia juga mudah untuk mencari asas +1 urutan mRNA (tapak permulaan transkripsi) dengan kaedah pelanjutan primer. Jumlah mRNA yang terdapat di dalam sampel boleh dikira dengan kaedah ini jika lebihan primer digunakan.

Rajah 02: Pelanjutan Primer

Apakah perbezaan di antara Terjemahan Nick dan Tambahan Primer?

- Diff Artikel Tengah sebelum Jadual ->

Nick Translation vs Primer Extension

Terjemahan Nick adalah proses yang membuat probe DNA berlabel untuk pelbagai tindak balas hibridisasi.

Lanjutan primer adalah teknik yang digunakan untuk mencari RNA khusus atau untuk mengkaji ekspresi gen. Enzim Digunakan
DNase 1 dan enzim polimerase DNA digunakan.
Enzim transkrip balik digunakan. Kepentingan
Terjemahan Nick memudahkan penandaan urutan DNA tertentu.
Lanjutan primer membolehkan pengesanan saiz urutan mRNA tertentu dan jumlah yang terdapat dalam sampel. Ringkasan - Terjemahan Nick vs Lanjutan Primer

Terjemahan Nick adalah satu kaedah yang digunakan untuk mensintesis probe berlabel berdasarkan aktiviti-aktiviti DNase 1 dan

E coli DNA polimerase 1 enzim. Ia adalah kaedah in vitro yang digunakan dalam makmal sebelum teknik hibridisasi yang berlainan. Semasa terjemahan nick, aktiviti exonuclease 5'-3 'polimerase DNA 1 membuang nukleotida menjelang aktiviti nick dan polimer DNA polimerase 1 menggantikan nukleotida yang dikeluarkan dengan nukleotida berlabel di belakang nikel. Pelanjutan primer adalah kaedah yang digunakan untuk mengesan transkrip RNA khusus dari campuran dan mengukur saiz dan jumlah RNA yang menarik. Ini adalah perbezaan antara terjemahan nick dan sambungan primer. Rujukan

1. Reid, Alex. "Terjemahan Nick. "Springer. N. p., n. d. Web. 18 Apr. 2017

2. "Peluasan Primer. "Diagnostik Kebangsaan. N. p., n. d. Web. 19 Apr. 2017

3. Kuo, M. T., dan W. Plunkett."Nick-translasi kromosom metaphase: pelabelan in vitro kawasan nukleus-hipersensitif dalam kromosom. "Prosiding Akademi Sains Negara Amerika Syarikat. U. S. Perpustakaan Perubatan Negara, Feb. 1985. Web. 19 Apr. 2017

4. Raymond et al. "Mudah, kuantitatif primer-lanjutan ujian PCR untuk pengawasan langsung mikroRNAs dan RNA pendek yang mengganggu. "RNA. Hak Cipta 2005 oleh RNA Society, Nov. 2005. Web. 19 Apr. 2017

Image Courtesy:

1. "Ujian Pelanjutan Primer" Oleh Jjnmmnjj - Kerja sendiri (CC BY-SA 3. 0) melalui Wikimedia Commons